MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome

Total Repeats: 11787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007681	T	7	7	8	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007681	A	7	7	18	24	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007681	A	8	8	59	66	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007681	TAAAA	2	10	73	82	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007681	AT	3	6	86	91	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007681	GTAA	2	8	110	117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007681	AT	3	6	120	125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007681	A	6	6	137	142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007681	A	9	9	180	188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007681	T	9	9	220	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007681	A	8	8	257	264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007681	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007681	A	6	6	322	327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007681	TAT	2	6	332	337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007681	TTA	2	6	338	343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007681	TTAT	2	8	345	352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007681	TA	3	6	353	358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007681	TAT	2	6	362	367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007681	TTA	3	9	368	376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007681	TATT	2	8	381	388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007681	TAT	2	6	392	397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007681	TTA	3	9	398	406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007681	TAT	2	6	410	415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007681	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007681	TATT	2	8	431	438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007681	TTTTA	2	10	439	448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007681	AT	4	8	449	456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007681	TTA	2	6	466	471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007681	AAT	2	6	485	490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007681	TATTTT	2	12	513	524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007681	CTT	2	6	535	540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007681	TTAT	2	8	565	572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007681	CT	3	6	597	602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007681	ATTA	2	8	632	639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007681	TAC	2	6	665	670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007681	AATATA	2	12	672	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007681	GGA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007681	CTA	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007681	T	6	6	1887	1892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007681	TAT	2	6	1906	1911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007681	CTC	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007681	TA	3	6	2274	2279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007681	AT	3	6	2294	2299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007681	T	7	7	2332	2338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007681	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007681	CTT	2	6	2406	2411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007681	T	8	8	2410	2417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007681	TTA	2	6	2422	2427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007681	ATT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007681	T	8	8	2490	2497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007681	TTC	2	6	2511	2516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007681	T	6	6	2520	2525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007681	TAT	3	9	4210	4218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007681	TATT	2	8	4233	4240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007681	ATA	2	6	9733	9738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007681	TTA	2	6	9759	9764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007681	T	7	7	9772	9778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007681	TAT	3	9	9787	9795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007681	TAAA	2	8	9856	9863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007681	TA	3	6	9873	9878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007681	ATA	3	9	9876	9884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007681	A	6	6	9898	9903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007681	A	6	6	9940	9945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007681	TTA	2	6	9946	9951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007681	A	6	6	9969	9974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007681	GAA	2	6	10000	10005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007681	A	7	7	10012	10018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007681	GAT	2	6	10032	10037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007681	T	8	8	10098	10105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007681	ATTA	2	8	10149	10156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007681	ATA	3	9	10164	10172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007681	TCT	2	6	11385	11390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007681	T	7	7	13139	13145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007681	ATTT	2	8	13155	13162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007681	TAT	3	9	13176	13184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007681	A	7	7	13187	13193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007681	T	6	6	13204	13209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007681	AAT	2	6	13218	13223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007681	ATA	2	6	13224	13229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007681	TAA	3	9	13800	13808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007681	T	8	8	13809	13816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007681	A	8	8	13819	13826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007681	TGGAA	2	10	13828	13837	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007681	ACTA	2	8	14932	14939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007681	TAA	2	6	14940	14945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007681	ATTAT	2	10	14965	14974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007681	ATA	3	9	14993	15001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007681	TTA	2	6	15003	15008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007681	ATT	2	6	15009	15014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007681	AAT	2	6	15022	15027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007681	GA	3	6	15035	15040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007681	T	9	9	17503	17511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007681	TAA	2	6	17522	17527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007681	ATT	2	6	17528	17533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007681	ATAA	2	8	17555	17562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007681	ATA	2	6	17601	17606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007681	ATT	2	6	17609	17614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007681	TTTA	2	8	17616	17623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007681	T	8	8	17646	17653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007681	CAT	2	6	17659	17664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007681	A	7	7	17675	17681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007681	TAT	2	6	18619	18624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007681	T	6	6	18636	18641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007681	TAT	2	6	18645	18650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007681	AT	4	8	18652	18659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007681	ATA	2	6	18667	18672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007681	T	7	7	18677	18683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007681	AAT	2	6	18684	18689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007681	TAA	2	6	19320	19325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007681	T	9	9	19326	19334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007681	T	7	7	19358	19364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007681	TAT	2	6	19366	19371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007681	T	7	7	19388	19394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007681	A	8	8	19445	19452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007681	ATTT	2	8	19460	19467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007681	ATTT	2	8	19480	19487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007681	TTA	2	6	19501	19506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007681	TCA	2	6	19543	19548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007681	CAA	2	6	19554	19559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007681	A	6	6	19572	19577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007681	AAT	2	6	19582	19587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007681	TATT	2	8	19592	19599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007681	TA	3	6	20951	20956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007681	ACT	2	6	20995	21000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007681	TATTT	2	10	21007	21016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007681	TGG	2	6	21024	21029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007681	AGG	2	6	21056	21061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007681	TCC	2	6	21080	21085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007681	ATTT	2	8	21091	21098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007681	TAA	2	6	21104	21109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007681	A	6	6	21120	21125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007681	TAT	2	6	21133	21138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007681	ATA	2	6	21139	21144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007681	ATTA	2	8	21161	21168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007681	ATTA	2	8	21195	21202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007681	A	7	7	21233	21239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007681	A	8	8	21242	21249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007681	TAT	2	6	22175	22180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007681	AT	3	6	22192	22197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007681	TTA	2	6	22226	22231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007681	TAT	2	6	22239	22244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007681	TAT	2	6	22253	22258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007681	ATT	2	6	22269	22274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007681	ACAT	2	8	22285	22292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007681	AT	3	6	22291	22296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007681	TAAA	2	8	24126	24133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007681	A	7	7	24131	24137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007681	T	7	7	24141	24147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007681	A	7	7	24161	24167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007681	AGA	2	6	24174	24179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007681	TA	3	6	25218	25223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007681	TA	3	6	25259	25264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007681	TTTAT	2	10	25274	25283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007681	CAT	2	6	25299	25304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_007681	TTA	2	6	59856	59861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_007681	TAA	2	6	59892	59897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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